Foniks Bahasa Indonesia dipilih karena melalui metode ini, anak-anak mengenal bunyi-bunyi huruf. Dengan mengenal bunyi huruf, anak akan menjadi lebih mudah membaca. Setelah anak-anak bisa membedakan bunyi-bunyi huruf, anak akan diajak untuk menggabungkan beragam bunyi huruf, hingga nantinya dapat mulai membaca. 

Pendekatan ini berbeda dengan mengajar membaca menggunakan suku kata (ba-bi-bu). Metode foniks berfokus pada bunyi huruf – simbol huruf – penggabungan bunyi huruf – makna kata yang dibaca. Dengan begitu, pengalaman berliterasi dalam program Mahir Literasi-Matematika (LiMa) juga berpegang pada prinsip “reading is understanding”. Apa yang dibaca anak-anak HARUS MEMILIKI ARTI. Anak tidak boleh membaca kata yang tidak ada artinya. AHA Moment dalam literasi akan muncul ketika anak berhasil membaca kata yang bermakna. Latihan membaca anak-anak dilakukan menggunakan buku AHA 1 dan AHA 2, dan Mahir Membaca, buku original Link Study Center yang sudah disesuaikan dengan level membaca anak.

Selain menggunakan metode multisensori, program Mahir Literasi-Matematika (LiMa) juga menyiapkan modul soal terstruktur. Anak-anak yang mengikuti program ini adalah anak-anak yang mempeprsiapkan diri untuk memasuki jenjang Sekolah Dasar sehingga modul-modul soal perlu mulai diberikan. Modul soal yang diberikan sudah terstruktur dan sistematis, sehingga melatih kemampuan anak sedikit demi sedikit.